برنج فجر مهم ترین محصول غذایی جهان، غذای اصلی و منبع اصلی غذا برای بخش بزرگی از جمعیت جهان است که بیش از نیمی از جمعیت جهان را تشکیل می دهند.
به عنوان مثال، آسیا که 60 درصد از مردم زمین در آن زندگی می کنند، بیش از 90 درصد برنج جهان را تولید و مصرف کرده است. به تدریج، بین دهه 1960 و 2000،
تولید برنج جهان حدود 300 درصد افزایش یافت و به ترتیب از 106×231 تن به 106×718 تن رسید. به این ترتیب میانگین سرانه برنج بیش از 20 درصد افزایش یافته
است. با وجود این رشد، میلیون ها مصرف کننده فقیر برنج هنوز گرسنه هستند. در حال حاضر، تخمین زده می شود که تقاضای جهانی برای تولید برنج همچنان در
حال افزایش است، جایی که جهان نیاز به تولید 25 درصد برنج بیشتر دارد، در نتیجه … نمایش محتوای بیشتر …
در اصلاح نباتات کلاسیک، افراد دوردست برای ایجاد ژنوتیپ‌های مفید هیبرید می‌شوند، اما برای انتخاب و ارزیابی آن ژنوتیپ‌ها به مدت طولانی و چندین نسل نیاز است
(Tester and Langridge, 2010) زیرا بر شناسایی بصری ژنوتیپ‌های بیان شده تکیه می‌کند. صفات (فنوتیپ). بنابراین، این رویکرد برای رویارویی با نیازهای رو به رشد
تقاضای مواد غذایی در سطح جهان محدود و غیر مفید است.
از سوی دیگر، امنیت غذایی امروزه به اصلاح نباتات مدرن بستگی دارد زیرا به جای شناسایی بصری، با تعیین ویژگی های بیان شده با روش های آزمایشگاهی، زمان
را حفظ می کند. اصلاح نباتات مدرن به عنوان اصلاح مولکولی نیز شناخته می شود. اصلاح مولکولی یکی از کاربردهای بیولوژی مولکولی و بیوتکنولوژی است، زیرا
شامل تعدادی حوزه مختلف است که شامل نقشه برداری QTL و کشف ژن، انتخاب به کمک نشانگر (MAS) و انتخاب ژنومیک (GS) می شود. و مهندسی ژنتیک (GE)
(گوزن و مامان، …نمایش مطالب بیشتر…
در مقایسه با GE، هیچ تبدیل یا تغییر DNA در طول فرآیند MAS وجود ندارد. این فقط یک پرورش سنتی با کمک نشانگرهای مولکولی است. همراه با پیشرفت بیشتر
پرورش مولکولی، طیفی از نشانگرهای مولکولی توسعه یافته است. در روزهای اولیه، نشانگرهای مبتنی بر پروتئین مانند ایزوآنزیم‌ها قبل از وجود نشانگرهای مبتنی بر
DNA وجود داشتند که پس از سال 1980 به طور گسترده مورد استفاده قرار گرفتند و قبل از کشف فناوری PCR مانند RFLP به دو کلاس (i) تقسیم شدند (Botstein et
al. .، 1980؛ Tanksley و همکاران، 1989، (ii) پس از کشف فناوری PCR. این کلاس شامل AFLP (ووس و همکاران، 1995)، RAPD (ویلیامز و همکاران، 1990)، و
ریزماهواره ها یا SSR ها (لیت و لوتی، 1989) بود. در گذشته اخیر، نشانگرهای مولکولی دیگری کشف شده اند که شامل SNP ها و نشانگرهای مبتنی بر ریزآرایه مانند
SFPs، نشانگرهای DArT و نشانگرهای با توان بالای مبتنی بر NGS هستند، اگرچه بسیاری از نشانگرهای قدیمی هنوز هستند.